Управление Государственной налоговой службы при Министерстве экономики:
Главное управление налоговой политики
Главное управление управления налоговыми рисками
Главное управление налогового аудита
Главное управление цифрового налогового администрирования
Главное управление международного налогообложения и налогового мониторинга
Главное управление контроля деклараций и камеральных налоговых проверок
Главное управление контроля исполнения экономического анализа и прогнозов
Главное юридическое управление
Главное управление внутренней безопасности
Главное управление внутреннего аудита
Главное управление по работе с человеческими ресурсами
Главное управление обслуживания налогоплательщиков
Главное управление по работе с документами и контролю исполнительской дисциплины (Секретариат)
Главное управление рассмотрения административных жалоб
Главное управление координации деятельности местных органов
Главное управление контроля регистрации и учета налогоплательщиков
Главное управление контроля исполнения налоговых обязательств
Главное управление службы налогового омбудсмена
Главное управление стратегического планирования и управления организационными рисками
Главное финансовое управление
Управление медии и коммуникации
Управление информационной безопасности
Управление анализа данных
Отдел управления проектами
Отдел финансового мониторинга
Протокольный отдел
Учреждения, входящие в структуру Государственной налоговой службы при Министерстве экономики:
Главное управление местных доходов города Баку
Главное управление организации оперативного налогового контроля и учета города Баку
Главное управление предварительного расследования налоговых преступлений
Главное управление национальных доходов
Главное управление контроля импортно-экспортных операций
Главное управление по управлению налоговыми обязательствами
Главное управление по контролю за обращением акцизных и маркированных товаров
Региональная налоговая служба №2
Территориальная налоговая инспекция №3
Региональная налоговая инспекция №4
Территориальная налоговая инспекция №5
Региональная налоговая служба №6
Районная налоговая инспекция № 8
Территориальная налоговая инспекция №9
10 Территориальная налоговая инспекция
11 Главное территориальное управление налогов
12 Главное территориальное управление налогов
13 Территориальная налоговая инспекция
14 Территориальная налоговая инспекция
Карабахское территориальное главное управление налогов
Восточно-Зангезурская территориальная налоговая инспекция
Подведомственное учреждение при Министерстве экономики, не входящее в структуру Государственной налоговой службы:
Учебный центр